Temas 2 y 3 del curso 2007-2008

2. Aminoácidos y péptidos. Aminoácidos: definición, composición elemental, estructura, isomería. Importancia biológica. Aminoácidos que forman parte de las proteínas: clasificación. Propiedades ácido-base: los aminoácidos como anfolitos, curvas de titulación. Clasificación. Propiedades químicas: grupo amino, grupo carboxilo, cadenas laterales. Propiedades físicas: solubilidad, propiedades ópticas. Péptidos: definición, estructura e importancia biológica. Enlace peptídico.

3. Proteínas. Introducción: importancia biológica, funciones. Proteínas fibrosas y globulares. Estructura de las proteínas: estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria: definición y características principales, enlaces e interacciones involucradas. Procesos de adquisición de la conformación nativa. Plegamiento espontáneo. Chaperonas. Cambios conformacionales en las proteínas. Desnaturalización. Degradación intracelular de proteínas.

Transparencias de clase en formato pdf (curso 2007-2008)

Aminoácidos, el enlace peptídico y péptidos

Evolución de proteínas (212 kB)

Estructura secundaria

Proteínas fibrosas y estructura terciaria

Estudio estructural de la enzima adenilato kinasa (563 kB)

Estructura cuaternaria (405 kB)

Adquisición de la conformación nativa (824 kB)

Otra información:

No he preparado temas interactivos en Jmol sobre la estructura de proteínas porque en BIOROM 2005 y 2006 existen varios temas de excelente calidad, y no tiene mucho sentido repetir un trabajo que ya está muy bien hecho. Es absolutamente conveniente trabajar con las lecciones de estructura de proteínas de BIOROM (o similares), dado que las transparencias no permiten apreciar bien los aspectos tridimensionales de la estructura de estas moléculas.

Por si quiere ver las moléculas que he empleado para preparar la mayor parte de las transparencias anteriores:  

Archivos PDB de aminoácidos y proteínas que se han usado para preparar las imágenes anteriores:

Archivoszip/moleculas1.zip    (288 kb)

Tutorial autoguiado sobre estructuras de proteínas. Descomprima el archivo y mueva la carpeta rasmol al directorio c:. Lea los documentos de MsWord antes de ejecutarlo. Contiene los archivos pdb, el programa RASMOL y los guiones. (731 kb). Es una versión antigua, del curso 2001-2002, pero puede ser útil si no se dispone de BIOROM:

Archivoszip/rasmol.zip

Proteínas en movimiento:

Animación de los cambios conformacionales sufridos por la enzima adenilato kinasa al unir su sustrato. Clemens Vonrhein, Gerd J Schlauderer and Georg E Schulz (1995). "Movie of the structural changes during a catalytic cycle of nucleoside monophosphate kinases".Structure 3(5),483-490. Es un "clasico" de estas animaciones. Se ha realizado interpolando estructuras conocidas de la enzima adenilato kinasa. NO es una visualización de los movimientos reales de la proteína.

En esta página se encuentran las animaciones originales

http://bio5.chemie.uni-freiburg.de/index.html